交通运输部收到申请材料和初审意见后，进行审查，会同国家发展改革委作出批准或者不予批准的决定。
　　第九条申请使用港口深水岸线的，港口所在地港口行政管理部门和省级人民政府港口行政管理部门应当在收到港口岸线使用申请材料后二十个工作日内完成现场核查、初审和转报工作。
　　交通运输部应当在收到港口岸线使用申请材料后二十个工作日内完成审查，并会同国家发展改革委作出审批决定。二十个工作日内不能办结的，经负责人批准，可以延长十个工作日。
　　岸线使用专家评审所需时间不计算在期限内。
　　第十条港口岸线使用申请审查、专家评审的主要内容包括：
　　（一）建设项目是否符合产业政策和港口规划；
　　（二）建设项目的必要性分析；
　　（三）工程可行性研究报告或者项目申请报告提出的岸线使用方案是否符合国家技术标准和规范；
　　（四）岸线使用方案的合理性分析；
　　（五）岸线使用方案是否满足航道、通航安全的相关要求；
　　（六）法律、法规和国家规定的其他要求。
　　第十一条由国务院或者国家发展改革委审批、核准的港口建设项目，向国家发展改革委报送可行性研究报告或者项目申请报告时，应当同时抄报交通运输部。交通运输部对港口建设项目提出行业意见时，一并提出岸线使用意见。
　　由国务院或者国家发展改革委审批、核准的其它建设项目，在港口总体规划区内建设港口设施，使用港口深水岸线的，国家发展改革委在审批、核准之前，征求交通运输部关于建设项目使用港口岸线的意见。
　　本条第一款、第二款所指建设项目，不再另行办理使用港口岸线的审批手续。
　　第十二条港口岸线使用审批机关审查决定批准港口岸线使用申请的，应当出具港口岸线使用批准文件。
　　审批机关决定不予批准使用港口岸线的，应当书面告知申请人，并且说明理由。
　　第十三条使用港口岸线的港口设施项目未取得港口岸线使用批准文件或者交通运输部关于使用港口岸线的意见，不予批准港口设施项目初步设计和施工许可。
　　第十四条被批准使用港口深水岸线的建设项目，应当在建设项目取得审批、核准文件后的十个工作日内，持港口岸线使用批准文件和建设项目审批、核准文件向交通运输部领取港口岸线使用证。
　　港口岸线使用证应当包括以下内容：
　　（一）岸线使用人；
　　（二）项目主要建设内容；
　　（三）岸线的范围和用途；
　　（四）有效期限；
　　（五）其它事项与要求。
　　本条所指港口岸线使用证由交通运输部统一制定。

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