关于印发《医院人感染H7N9禽流感病毒核酸检测标准操作程序》等技术规范的通知(4)
1.4. 核酸洗脱
1.4.1 将核酸吸附柱装入一无核酸酶1.5ml离心管,小心在吸附膜中央加入50μl预热洗脱液,室温静置4分钟。
1.4.2 10000 rpm离心2分钟,离心管中液体即待测样本RNA。
2. PCR扩增:
2.1 实验设计:
2.1.1待检样本检测:每份样本分别使用2种反应液(H7和N9反应液)进行检测,综合2种反应液的检测结果对样本进行判定。
2.1.2对照品检测:每次试验都应设置阴性对照和阳性对照。
2.2反应体系的配制:
2.2.1准备工作:将2种反应液(H7和N9反应液)融化后振荡混匀,离心6000rpm 10秒。
2.2.2 2种反应体系(H7和N9)的配制:取2个1.5ml 无核酸酶离心管,计算待测样本数量(n),分别取20μl×(n+2)反应液(H7和N9)、0.5μl×(n+2)DNA聚合酶和0.5μl×(n+2)逆转录酶充分混匀,离心6000rpm 10秒。
n + 2 = n份样本+1份阳性对照+1份阴性对照;
2.3反应体系分管:
每份待测样本设置2个PCR扩增管(H7和N9),分别将每种反应体系按20μl/管分装至对应的PCR扩增管中。
2.4加样:
每份待测样本RNA、阳性对照、阴性对照以5μl/管分别加入2个PCR扩增管中。
2.5扩增检测:
将加样后的PCR扩增管分别转移到全自动荧光定量PCR检测仪上进行扩增检测,不同仪器的设置如下:
2.5.1全自动荧光定量PCR检测仪(RG3000、ABI Prism 7500、ABI Prism 7000型)扩增程序:
对于ABI Prism 7500、ABI Prism 7000型全自动荧光定量PCR检测仪,荧光信号设置为:Reporter Dye1:FAM、JOE/VIC,Quencher Dye1:NONE,Passive Reference:NONE。其他型号仪器可设置为FAM和HEX通道。荧光PCR扩增程序的设置见表1。反应总体积为25μl。
表1.荧光PCR扩增程序
步骤 反应温度 时间 是否采集光 循环数
逆转录及变性 50℃ 30分钟 否 1
95℃ 3分钟 否
预扩增 95℃ 15秒 否 5
50℃ 30秒 否
72℃ 1分钟 否
扩增及荧光收集 95℃ 10秒 否 40
55℃ 40秒 是
2.5.2 全自动荧光定量PCR仪(Roche LightCycler系列)扩增程序:
选择FAM、HEX通道收集荧光。荧光PCR扩增程序见表2。
表2.荧光PCR扩增程序
步骤 反应温度 时间 是否采集荧光 循环数
逆转录及变性 50℃ 30分钟 否 1
93℃ 3分钟 否
预扩增 93℃ 15秒 否 5
50℃ 30秒 否
72℃ 1分钟 否
扩增及荧光收集 93℃ 10秒 否 40
55℃ 40秒 是
3. 结果分析:
3.1本品H7荧光探针的报告荧光为FAM,N9荧光探针的报告荧光为FAM,RNP荧光探针的报告荧光为HEX。所以应选择FAM通道和HEX通道分析试验结果。
3.2 基线(Baseline)范围根据仪器要求设定,目的为校正背景荧光干扰,终止循环(End)一般设置为最强样本出现扩增信号的前3-4个循环。
3.3 阈值线用于判断样本是否扩增,应调整使阈值线高于荧光背景和阴性对照的荧光信号,或点击分析(Analysis)自动获得。
4. 质量控制:
每次试验应设置阳性对照和阴性对照,且应符合以下要求,否则试验结果不成立。
4.1阴性对照无Ct值或Ct值为0。
4.2 阳性对照Ct值小于30.0。
【参考值(参考范围)】
Ct值≤37.0报告该反应阳性;
无Ct值或Ct值为0报告该反应阴性;
37.0<Ct值<40.0为灰区;
内标RNP有效的范围为:0<Ct值<33.0;
【检验结果的解释】
1. 在内标RNP结果成立的条件下各种判读模式如下:
反应液 模式1 模式2 模式3 模式4
H7 - - + +
N9 - + - +
RNP + + + +
结果判断 H7N9亚型禽流感病毒RNA阴性 H7N9亚型禽流感病毒RNA阴性 H7N9亚型禽流感病毒RNA阴性 H7N9亚型禽流感病毒RNA阳性
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